Wersja beta zawiera pełny komplet mechanizmów i według zapewnień Microsoftu wersja finalna BizTalk Server 2009 pojawi się w pierwszej połowie przyszłego roku. Zestaw mechanizmów zawartych w tej wersji oprogramowania ma zapewnić bardziej wartościową warstwę pośredniczącą dla biznesu oraz lepszą integrację z innym oprogramowaniem Microsoftu, takim jak Windows Server 2008, oprogramowanie wirtualizacji i narzędzia programistyczne Visual Studio.

Microsoft udostępnił również BizTalk RFID Mobile, moduł oprogramowania rozszerzający możliwości klienta RFID na Windows Mobile i Windows CE. Moduł dostępny jest dla użytkowników BizTalk Server 2006 R2 i zawarty będzie również w BizTalk Server 2009.

Firma udostępniła także BizTalk RFID Standards Pack, który zapewnia wsparcie standardów RFID, Tag Data Translation i Low Level Reader Protocol.

BizTalk Server 2009 początkowo był projektowany jako wersja R3 BizTalk Server 2006. Jednak we wrześniu br. Microsoft zrewidował plany rozwojowe BizTalk i wprowadził nową nazwę dla tej wersji produktu. Firma planuje też następną wersję - BizTalk 7, której szczegóły ma ujawnić na początku roku 2009.

BizTalk Server 2009 zawiera wsparcie Windows Server 2008, Microsoft Visual Studio 2008 SP1, Visual Studio Team System i Team Foundation Server, Microsoft SQL Server 2008 i .NET Framework 3.5 SP1.

Nowa wersja zawierać będzie także możliwość integracji z Oracle E-Business Suite oraz uaktualnione wsparcie dla najnowszych wersji IBM Customer Information Control System, Information Management System, DB2, DB2/400, DB2 Universal Database i WebSphere MQ.